較牢固的忠誠，但項目團隊也需要他們的忠誠奉獻。
另外，必要時應通過調整項目成員的配備來調節(jié)雙方的矛盾。
當然，為了達到整個組織在時間、費用及效能之間更好的平衡，項目經理與部門經理進行有效的溝通是十分必要的。要根本解決雙方之間的沖突時，項目經理及部門經理必須共同站在企業(yè)的高度上對項目加以認識及理解，了解項目所在的企業(yè)，了解企業(yè)所處的環(huán)境，這樣才能對項目重要性、對資源的需求，以及資源的可獲得性有一個更充分的認識，從而管理好項目。因此，若項目經理僅僅關心自身項目的完成，或者部門經理只注重本部門的小利益時，犧牲的是企業(yè)的利益，最終也必然阻礙項目執(zhí)行，同時損害部門利益。
最后，當兩者之間的沖突難以解決時，就必須有更高層的管理人員出面解決。這里項目副總裁，作為項目經理的匯報對象，也是職能經理的行政領導，在矩陣組織中的角色十分重要。例如他可以解決組織內兩三個項目間在先后次序上的沖突，并對沖突進行仲裁。
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