質量達標的考核辦法以及負責各項考核的人員或部門。
項目完成后如果研發(fā)費用沒有用完，研究院可以設定統一的獎勵標準，例如拿出被節(jié)約費用的50％或者30％對研發(fā)小組進行額外獎勵。引導科研人員在實踐工作中向節(jié)約成本的方向努力。
三、分段考核、分段獎勵
新藥研發(fā)周期比較長，為了有效的激勵科研人員，科研項目管理部需要將項目按照項目任務書計劃設定的結點分成階段進行管理，每一個階段終止都有相應的考核標準對完成情況進行考核；另外，還要將獎金按照項目劃分的結點實行分段分配。例如：某項目被劃分為5個結點進行考核，但是獎金并不是按照每份20％進行分配。提成金分配的原則是“工作難度大的結點提成比例較多，難度小的提成比例較少；項目前期的提成比例較少，后期的提成比例較多。
獎勵金分段支付的理由：其一，攻克一個階段性目標進行一次獎勵，比較有利于充分發(fā)揮激勵機制的效用；其二，在項目整體完成之前，財務部僅兌現計劃結點獎勵金額的50％，另外50％存留在本項目帳戶上，每年年底再統一結算。如果項目到年底沒有全部完成，財務部則需要根據剩余項目金額多少，為明年預留出一定比例的風險抵押金。這種做法一方面使技術人員得到了可見的物質獎勵，另外用他們本來已經到手的物質獎勵中的50％作為風險抵押金，引導他們努力完成所有的階段性目標。
四、項目對內招標
當以上前期各項準備工作完成之后，每個項目的責任、利益、考核辦法等都已經非常明確。此時，科研項目管理部可以將各個項目拿出來對內進行招標。愿意成為項目負責人的技術人員需要申報自己可以組成的研發(fā)小組主要成員名單。管理部門負責根據項目需要在競標人中擇優(yōu)選定項目責任人；項目小組的參與人員由項目負責人進行自愿組合，科研項目管理部行使審批權。
如果個別項目出現無人競標的局面，說明此項目責任和利益之間出現了不匹配，或者設定的考核目標過于困難，此時科研項目管理部需要進行調整。如果個別項目出現眾人競標的局面，說明目標易于達成，管理部門可以在認為競爭者有此工作能力的前提下，通過競標的方式降低獎勵水平，或者提高工作要求。
科研項目管理部可以制定以下規(guī)則：例如二級研究員最多可以同時做3個項目的負責人，二級最多可以同時做2個項目的負責人，一級研究員一次只能做1個項目的負責人，項目負責人也可以在其它人員負責的項目中充當參與者，數量不受限制。另外，項目負責人必須在一個項目徹底完成之后，才能競標另外一個新項目的負責人。這樣做的目的就是為了引導技術人員通過快速高效的工作多拿獎金。
五、簽訂《項目研發(fā)任務書》
科研項目管理部負責針對各研發(fā)項目設計《項目研發(fā)任務書》，其中包括研發(fā)小組在本項目中詳盡的責任、利益、時間結點、考核辦法等等?？蒲许椖抗芾聿窟x定項目負責人之后，分別由主管領導、項目負責人、項目主要參與人員三方在《項目研發(fā)任務書》上簽字，作為對研發(fā)小組將來的獎懲依據。
《項目研發(fā)任務書》分為四聯，第一聯由研究院項目管理部負責保存；第二聯交給項目負責人；第三聯財務部入賬；第四聯科研項目管理專員用于記錄項目小組的工作進展狀況，此聯在項目未完成前留在財務部。財務部根據由科研項目管理部簽字提供的項目進展情況隨時結出獎勵款額的50％，由項目負責人簽收。另外50％存留在本項目帳戶上，每年年底企業(yè)統一結算一次。待項目徹底完成后可以立即將第四聯抽出退給項目負責人。項目負責人將以此為憑據，參加新的項目競標。
凡是時間到達計劃結點時仍不能要求提成的項目，即為項目小組違約。違約金將按照責任書中的制度進行處罰。例如結點完成日期每延期一星期，將扣除此結點上一定比例的提成和一定金