對于企業(yè)來說，項目運作已經是非常常見的業(yè)務開展模式，但是即使是哪些經驗豐富的決策者也很難選定適合企業(yè)的項目組織形式，這一選擇是根據具體的情況決定的，有時也會靠直覺而定。職能組織適于那些注重技術的使用深度，而不是關注成本最小化，滿足特定進度要求，提高對變化的反應速度的項目。同時，對那些通常由職能部門使用的設備和場所進行大量投資的項目，也采用這種組織形式。
如果公司從事的大量項目都較相似(如施工項目)，那么純項目型組織便是首選。這種形式一般適合完成一次性、獨特的并需要周密控制的任務，但對于像開發(fā)新生產線這樣單一職能領域的任務就不適用了。在這方面還是存在一些可接受的設計原則，雖然沒有為決定采用何種結構以及如何建立這種結構做成詳細說明的步驟程序，我們所能做的便是認真分析潛在項目的性質，各種組織形式的特點及優(yōu)勢和劣勢，企業(yè)文化傾向，以及所能做出的最佳折中方案。
如果項目的開展需要多個職能部門的協(xié)調并設計復雜的技術問題，但有不要求技術專家全日制參與的話，矩陣型組織是唯一令人滿意的選擇，尤其是若干項目需要共享技術專家的情況下作用更加明顯，不過它的復雜性對項目經理是一個挑戰(zhàn)。
理解了各種組織形式的優(yōu)缺點，企業(yè)才能選擇更有效的組織形式。組織形式選擇的步驟可以概括為以下幾步：
1、通過對項目目標的描述來定義項目的預期產出;
2、確定于每個項目相聯(lián)系的主要任務及負責機構;
3、對關鍵任務進行排序，并進行工作分解;
4、確定工作實施部門以及相關協(xié)調部門;
5、列舉特定和項目條件，如技術水平、持續(xù)時間、項目規(guī)模、人員問題、不同部門之間的政治分歧以及其他相關問題，包括公司在用不同的組織形式管理項目方面的經驗;
6、結合以上各項，通過掌握各種組織形式的優(yōu)點和缺點，最終選擇一種組織形式。
首先是確定目標，其次是列出與項目目標相對應的任務，對每一項任務要明確應負責的職能單位，這是開展項目的基本要素。問題的關鍵是如何組織他們，如何使他們更好地、一致地工作，然后考慮的是項目實施人(項目團隊)、個人素質、技術因素、服務的對象、職能部門間的關系、公司的文化背景等，公司的內外部因素應考慮進去。所以要對項目組織結構進行選擇，要先確定項目性質、這就需要制定一份項目初步的、嚴密的計劃。